隨著面積45萬平方米合肥創新平臺一期項目的全面交付使用，創新平臺二期建設工作也正式啟動。目前，該項目正在進行測繪、設計等前期工作，有望今年3月下旬開工建設。
合肥創新平臺二期位于合肥國家科技創新型試點市示范區文曲路與潛水東路交叉口西北側，占地約287畝，總建筑面積約70萬平方米，計劃總投資約20億元。項目主要由科研集群基地、科技咨詢基地、孵化器與加速器及公共服務中心等組成，是一項集創新創業綜合服務、研發、商務辦公、行政辦公、會議展示等公共服務復合功能為一體的高檔次、多樣化、生態型的大型現代創新產業平臺。項目以建立合肥經濟圈區域創新體系為目標，建成后將有力提升合肥的區域創新能力、產業競爭力和可持續發展能力，年總產值將超過10億元。
合肥創新平臺包括科技創新公共服務中心，科研集群基地、孵化基地、產業基地，于2009年6月啟動。二期項目建設工期約2年，預計2014年3月建成投用。